Řeka Labe protéká Špindlerovým Mlýnem od severu k jihu a v dolní části města za silničním mostem se stáčí téměř na západ a míří do přehrady Labská. Najdeme tu spoustu mostů a jezů, břehy řeky jsou v horní části bohatě porostlé, v centru města pak méně a v dolní části zase více. Špindlerův Mlýn je vůbec prvním sídlem na Labi. Z několika vyhlídek se lze kochat uklidňujícím pohledem do proudící vody.